20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45660 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  278  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  71.76 
 
 
164 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  72.52 
 
 
130 aa  202  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  59.23 
 
 
151 aa  183  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  59.09 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  59.09 
 
 
134 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  59.09 
 
 
134 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  61.07 
 
 
131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  58.33 
 
 
145 aa  178  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  59.69 
 
 
134 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  61.74 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  56 
 
 
155 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  54.76 
 
 
137 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  56.67 
 
 
137 aa  156  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  53.97 
 
 
137 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  52.24 
 
 
137 aa  150  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  52.24 
 
 
137 aa  150  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  50.74 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  56.07 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  49.19 
 
 
172 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>