21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4354 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  95.33 
 
 		 137 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  94.39 
 
 		 137 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  94.39 
 
 		 137 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  89.72 
 
 		 155 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  66.36 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  60.75 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  60.19 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  60.75 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  60.75 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  64.49 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  62.86 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  58.88 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  59.81 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  57.94 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  62.39 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  62.39 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  56.07 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  59.43 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  57.14 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  30.85 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>