19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0589 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  100 
 
 
220 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2373  hypothetical protein  65.52 
 
 
116 aa  177  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960402  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3592  protein of unknown function UPF0153  64.96 
 
 
117 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2522  protein of unknown function UPF0153  64.96 
 
 
117 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.245259  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3172  hypothetical protein  62.93 
 
 
116 aa  170  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  59.48 
 
 
116 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4540  protein of unknown function UPF0153  62.16 
 
 
116 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2303  hypothetical protein  54.31 
 
 
122 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.798576  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1317  hypothetical protein  47.75 
 
 
124 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1158  hypothetical protein  47.27 
 
 
124 aa  111  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.308257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14501  Fe-S-cluster oxidoreductase  43.59 
 
 
124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  42.11 
 
 
115 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  41.23 
 
 
115 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  35.65 
 
 
115 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  36.75 
 
 
115 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09121  Fe-S-cluster oxidoreductase  37.5 
 
 
121 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.598462  hitchhiker  0.00000874271 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  35 
 
 
124 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  35 
 
 
124 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>