62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2203 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  54.49 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  55.13 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  54.84 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  55.13 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  53.55 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  54.19 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  54.19 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  53.85 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  52.56 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  50.64 
 
 		 156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  50.64 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  50.64 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  50.64 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  49.69 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  50 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  31.25 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  32.17 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  31.43 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  28.28 
 
 		 507 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  27.97 
 
 		 533 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  32.76 
 
 		 346 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  34.82 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  28.45 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  29.85 
 
 		 438 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  31.62 
 
 		 565 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  31.62 
 
 		 565 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  31.62 
 
 		 565 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  28.81 
 
 		 540 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  33.63 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  25.69 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  37.33 
 
 		 545 aa  47.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  29.73 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  26.76 
 
 		 419 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  40 
 
 		 437 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  33.03 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  32.65 
 
 		 547 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  29.1 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  31.18 
 
 		 204 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  31.31 
 
 		 550 aa  43.9  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  29.1 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  24.26 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  31.36 
 
 		 581 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  31.65 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  30.67 
 
 		 563 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  30.67 
 
 		 563 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  34.04 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  28.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  30.67 
 
 		 563 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  30.67 
 
 		 568 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  31.58 
 
 		 243 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  27.14 
 
 		 370 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  30.58 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  38.36 
 
 		 438 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  38.36 
 
 		 430 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  38.36 
 
 		 438 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  27.27 
 
 		 693 aa  40.8  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  35.9 
 
 		 430 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  35.9 
 
 		 430 aa  40.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>