132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3550 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  85.19 
 
 		 243 aa  417  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  37.6 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  33.06 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  37.89 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  38.2 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  36.33 
 
 		 283 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  34.63 
 
 		 344 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  34.69 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  35.96 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  33.46 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  35.42 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  34 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  30.92 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  35.5 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  29.66 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  33.88 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.53 
 
 		 340 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.53 
 
 		 340 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  32.44 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.73 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.53 
 
 		 340 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.53 
 
 		 340 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  30.53 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  30.15 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.33 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.92 
 
 		 339 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  29.82 
 
 		 240 aa  98.6  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  28.74 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  36.53 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  28.85 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  33.9 
 
 		 306 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  32.44 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  29.18 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  31.97 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  32.82 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  34.51 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  33 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  29.72 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  34.62 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  34.26 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  30.27 
 
 		 345 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  32.91 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  30.5 
 
 		 295 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  28.51 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  26.85 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  30.19 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  28.33 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  33.52 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  29.17 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  32.44 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  28.2 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  27.72 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  28.74 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  35.25 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  31.52 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  27.21 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  27.47 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  32.39 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  31.82 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  34.08 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  29.6 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  30.12 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.33 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  27.94 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  29.82 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  29.32 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  25.53 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  33.51 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  31.11 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  31.92 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34732  predicted protein  35 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0245742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  27.84 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  27.97 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  33.74 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  28.85 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  29.09 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  25.56 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  35.14 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  31.49 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  25.79 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  30.37 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  23.74 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  26.79 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>