44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1455 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  76.92 
 
 		 156 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  74.36 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  74.36 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  74.36 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  74.36 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  74.36 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  73.72 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  73.08 
 
 		 156 aa  248  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  73.08 
 
 		 156 aa  247  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  73.72 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  71.15 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  65.38 
 
 		 156 aa  217  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  61.29 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  54.49 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  29.79 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  28.57 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  33.91 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  32.32 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  27.63 
 
 		 507 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.71 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  36.99 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  37.04 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  32.56 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  30.33 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  26.95 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  24.79 
 
 		 533 aa  43.9  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  32.04 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  26.14 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  31.9 
 
 		 346 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.35 
 
 		 438 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  28.23 
 
 		 369 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 		 419 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  31.07 
 
 		 241 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  29.17 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  30.1 
 
 		 241 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  38.71 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  25.36 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  44.44 
 
 		 250 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  31.09 
 
 		 478 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  54.29 
 
 		 194 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>