61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4768 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  67.03 
 
 		 188 aa  231  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  58.29 
 
 		 505 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  57.22 
 
 		 508 aa  191  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  54.4 
 
 		 490 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  53.04 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  42.46 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  49.14 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  41.71 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  37.36 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  34.68 
 
 		 438 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  43.08 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  33.75 
 
 		 167 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  32.26 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  34.88 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  37.66 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  44.17 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  35.52 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  33.97 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  29.56 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.94 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  28.37 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.11 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  28.74 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  27.91 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  43.04 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  29.49 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  31.01 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  32.09 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  34 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  33.72 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  33.33 
 
 		 507 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  40.51 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  34.41 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  38.16 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  23.78 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  34.07 
 
 		 363 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04350  hypothetical protein  27.92 
 
 		 966 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  29.32 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  25.58 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  40.28 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  40.32 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  32.56 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  32.18 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2630  hypothetical protein  36.05 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.371489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  41.33 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  37.84 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  42.86 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  41.27 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  47.37 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  32.41 
 
 		 478 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  43.59 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  38.78 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  30.12 
 
 		 562 aa  40.8  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>