37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0167 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  43.08 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  38.73 
 
 		 505 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  34.38 
 
 		 490 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.37 
 
 		 508 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  35.34 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  30.07 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  36.84 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  28.97 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  31.21 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  29.53 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.86 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  26.71 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  31.85 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  31.08 
 
 		 438 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  30.13 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  31.61 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  32.63 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  22.11 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  28.83 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.14 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.36 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  36.05 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  35.9 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  24.35 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  24.35 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  33.33 
 
 		 507 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  31 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  25.74 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  30.58 
 
 		 269 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  32.53 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>