47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2793 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  53.14 
 
 		 505 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  52 
 
 		 490 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  51.96 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  53.04 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  50.87 
 
 		 508 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  44 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  49.06 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  40.23 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  33.33 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  37.66 
 
 		 155 aa  95.5  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  31.85 
 
 		 164 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  30.36 
 
 		 170 aa  88.2  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  31.76 
 
 		 166 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.64 
 
 		 164 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  33.33 
 
 		 165 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  34.59 
 
 		 189 aa  84.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  28.25 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  29.19 
 
 		 438 aa  78.2  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  41.53 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  27.17 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  26.59 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  33.57 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  27.06 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  27.73 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.93 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  36.26 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  27.01 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  31.34 
 
 		 165 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  31.82 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  28.99 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  43.75 
 
 		 169 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  23.84 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  36.14 
 
 		 188 aa  45.1  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5464  dual specificity protein phosphatase  41.38 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  hitchhiker  0.000857029 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  36.73 
 
 		 562 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  33.66 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14549  predicted protein  32.38 
 
 		 171 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  35.79 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  44.93 
 
 		 143 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  34.85 
 
 		 370 aa  41.6  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  29.92 
 
 		 163 aa  41.6  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>