41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3713 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  40.76 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  35.44 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  40.13 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  40.12 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  37.8 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  36.53 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  37.42 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  36.08 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  41.51 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.33 
 
 		 508 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  30.36 
 
 		 209 aa  88.2  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.24 
 
 		 490 aa  87.8  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  24.85 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  25 
 
 		 505 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  26.9 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  28.37 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  28.08 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  28.48 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  27.43 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  30.82 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  32.37 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  24.43 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  36.36 
 
 		 478 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.68 
 
 		 438 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  30.66 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  23.93 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  22.11 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  31.65 
 
 		 222 aa  47.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.64 
 
 		 190 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2630  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.371489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  28.78 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  27.97 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  45.83 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  25.21 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.82 
 
 		 419 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  24.79 
 
 		 121 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  28.03 
 
 		 500 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  29.63 
 
 		 562 aa  40.8  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>