40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2817 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  64.24 
 
 		 164 aa  219  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  61.96 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  59.26 
 
 		 165 aa  207  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  39.88 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  42.5 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  40.51 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  36.88 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  42.86 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  40.62 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  33.73 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.91 
 
 		 505 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.82 
 
 		 490 aa  84.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.38 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  31.25 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  34.38 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  27.06 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  32.05 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  29.66 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  29.03 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  30.13 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.1 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  30.89 
 
 		 438 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  30.56 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  28.83 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0154  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0309  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  25.89 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  29.46 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  25.6 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 		 500 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  32.05 
 
 		 562 aa  43.9  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  28.93 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  27.05 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  25.93 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  37.66 
 
 		 161 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  27.87 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  28.69 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>