48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2494 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 156 aa  324  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  91.67 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  91.67 
 
 		 156 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  89.74 
 
 		 156 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  89.74 
 
 		 156 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  89.74 
 
 		 156 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  89.1 
 
 		 156 aa  296  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  89.74 
 
 		 156 aa  297  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  89.74 
 
 		 156 aa  296  9e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  260  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  258  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  76.92 
 
 		 156 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  76.92 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  64.1 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  61.94 
 
 		 159 aa  215  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  54.84 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  36.84 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  38.04 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  35.54 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  27.07 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 		 241 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  27.14 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  29.82 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  30 
 
 		 560 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.27 
 
 		 533 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 346 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  31.3 
 
 		 563 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  31.86 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  31.58 
 
 		 568 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.97 
 
 		 438 aa  43.9  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  26.73 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  30.09 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  29.2 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  31.31 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  25.83 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  24.5 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  28.97 
 
 		 223 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  25.32 
 
 		 197 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  32.18 
 
 		 214 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  45.24 
 
 		 250 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  31.25 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  28.12 
 
 		 550 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  25.58 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  25.95 
 
 		 241 aa  40.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>