42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00295 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  100 
 
 
164 aa  332  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  87.2 
 
 
164 aa  298  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  64.24 
 
 
165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  57.32 
 
 
165 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  39.26 
 
 
168 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  43.64 
 
 
167 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  37.42 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  40.37 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  39.75 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  36.65 
 
 
166 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.01 
 
 
505 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  35.29 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  30.64 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  29.94 
 
 
197 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.18 
 
 
490 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.82 
 
 
508 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  29.94 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  33.76 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.33 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  29.71 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  27.86 
 
 
438 aa  54.7  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  26.29 
 
 
206 aa  54.3  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.39 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  27.94 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  32.05 
 
 
562 aa  48.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  31.71 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  28.17 
 
 
500 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  26.27 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  28.22 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  27.03 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  26.15 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  28.46 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  25.56 
 
 
547 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  25.95 
 
 
550 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  26.02 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  39.71 
 
 
188 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  28.87 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  27.82 
 
 
560 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  30.09 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>