61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1410 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
182 aa  361  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  49.41 
 
 
490 aa  155  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  50.88 
 
 
505 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  50.88 
 
 
508 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  43.43 
 
 
197 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  49.14 
 
 
185 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  49.06 
 
 
209 aa  137  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  47.02 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  41.46 
 
 
179 aa  101  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  38.89 
 
 
197 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  34.09 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  38.16 
 
 
167 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  37.5 
 
 
165 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  34.94 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  35.29 
 
 
164 aa  87.8  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  36.94 
 
 
155 aa  87.4  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  31.25 
 
 
438 aa  85.1  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  35.34 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  34.55 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  35.8 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  38.26 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  26.9 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  31.43 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  30.59 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  30.59 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  34.38 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  33.05 
 
 
140 aa  61.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.44 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  29.49 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  32.95 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  40.86 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  30.67 
 
 
507 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  39.53 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  36.56 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.12 
 
 
478 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  40.58 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  35.48 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  33.33 
 
 
478 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  39 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  25.9 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  33.33 
 
 
158 aa  47.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  30.66 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  35.29 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  29.56 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  28.28 
 
 
540 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  44.83 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  35.29 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  30.3 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  27.33 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
419 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  34.07 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  33.68 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  36.45 
 
 
369 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  22.83 
 
 
162 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  28.04 
 
 
547 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.94 
 
 
539 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  26.42 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  31.54 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>