41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0541 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
165 aa  339  9e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 
161 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  69.43 
 
 
165 aa  250  6e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  64.97 
 
 
163 aa  223  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  37.33 
 
 
147 aa  99  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  35.48 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  38.26 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  29.01 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 
185 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.54 
 
 
508 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  31.82 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  30.23 
 
 
438 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04770  phosphoprotein phosphatase, putative  35.71 
 
 
761 aa  49.3  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00163033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  27.64 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  28.47 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  36.96 
 
 
507 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  36.05 
 
 
178 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 
163 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  33.96 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  31.58 
 
 
163 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  29.56 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  34.67 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  32.31 
 
 
562 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3481  dual specificity protein phosphatase  32.12 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  37.21 
 
 
181 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  24.69 
 
 
246 aa  44.3  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  28.21 
 
 
179 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1539  Dual specificity protein phosphatase  34.52 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0521424  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  32 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  30.36 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.61 
 
 
505 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  26.87 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  33.67 
 
 
581 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05057  protein-tyrosine phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12250)  24.66 
 
 
595 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000599023  hitchhiker  0.0000000000000767856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  26.62 
 
 
197 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  29.79 
 
 
121 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.59 
 
 
478 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  25.38 
 
 
191 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  25.2 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  27.72 
 
 
188 aa  40.8  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>