35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2144 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  34.95 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  37.17 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  35.45 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  37.25 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  32.29 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  35.09 
 
 
142 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  35.09 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  38.55 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  31.52 
 
 
165 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  29.52 
 
 
431 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  36.14 
 
 
206 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  31.43 
 
 
554 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  33.02 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  30.36 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  27.21 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  27.55 
 
 
432 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
241 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  36 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  26.26 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  26.26 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  24.32 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  28.28 
 
 
142 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  41.05 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  32.95 
 
 
556 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  31.25 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  38 
 
 
116 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  31.37 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  38.04 
 
 
170 aa  40.8  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  23.36 
 
 
197 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  26.26 
 
 
241 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  25.66 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  33.01 
 
 
117 aa  40.8  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  27.27 
 
 
109 aa  40.4  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>