55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1926 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  51.23 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  44.85 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  43.64 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  41.82 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  41.36 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  43.83 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  43.83 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  36.08 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  42.5 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  35.67 
 
 		 490 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  38.04 
 
 		 508 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 209 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  35.84 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  36.26 
 
 		 505 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  38.16 
 
 		 182 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  34.68 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  33.75 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32.58 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  31.13 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  33.89 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.21 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  36.97 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  36.13 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  29.38 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  30.65 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  29.76 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.58 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  28.86 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  31.5 
 
 		 500 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  28.81 
 
 		 369 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  35.48 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  26.28 
 
 		 370 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  29.66 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  23.64 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05057  protein-tyrosine phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12250)  30.85 
 
 		 595 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000599023  hitchhiker  0.0000000000000767856 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  25.35 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  38.33 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  26.23 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  25.64 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  37.29 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  29.57 
 
 		 419 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  31.67 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  29.49 
 
 		 478 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  36.67 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  33.75 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  30.83 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36571  predicted protein  26.36 
 
 		 653 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136589  normal  0.0275107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  26.4 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  22.06 
 
 		 152 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  26.87 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  40 
 
 		 562 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  28.81 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  27.35 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>