70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0588 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  100 
 
 
165 aa  334  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  57.32 
 
 
164 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  56.71 
 
 
164 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  59.26 
 
 
165 aa  178  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  38.89 
 
 
168 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  41.36 
 
 
167 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  40.12 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  35.19 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  40.74 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  39.88 
 
 
163 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  37.5 
 
 
182 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  34.87 
 
 
197 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.3 
 
 
508 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.61 
 
 
490 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
209 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  34.88 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  34 
 
 
505 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
438 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32.77 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  33.76 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.07 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  34.75 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  34.82 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  29.79 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  26.72 
 
 
206 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  28.78 
 
 
140 aa  58.2  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  27.14 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  28.47 
 
 
162 aa  57.4  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  32.64 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.14 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  31.43 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  29.56 
 
 
189 aa  53.9  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  28.47 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  28.03 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  27.97 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  28.97 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  27.61 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  27.14 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34403  predicted protein  27.19 
 
 
232 aa  48.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  27.14 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  27.64 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  27.14 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  27.14 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  27.14 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  27.48 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  30.3 
 
 
562 aa  47.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
500 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  24.09 
 
 
152 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  30.94 
 
 
369 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  25.36 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  38.24 
 
 
222 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  25.42 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  34.18 
 
 
189 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4369  dual specificity protein phosphatase  26.76 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  32.91 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  28.8 
 
 
507 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  27.89 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  25.36 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  30.97 
 
 
478 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  23.6 
 
 
226 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 
370 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  28.57 
 
 
183 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  32.91 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  25.41 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  24.29 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>