57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3124 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  93.59 
 
 		 156 aa  313  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  92.95 
 
 		 156 aa  313  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  92.95 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  91.67 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  86.54 
 
 		 156 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 		 156 aa  256  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  74.36 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  64.74 
 
 		 156 aa  223  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  60 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  53.85 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  38.18 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  37.61 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  37.36 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  27.82 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  32.23 
 
 		 241 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  27.63 
 
 		 507 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  30.7 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 241 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  27.14 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  31.58 
 
 		 568 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  27.08 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  27.62 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  27.21 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  26.19 
 
 		 241 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  31.86 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  34.33 
 
 		 269 aa  43.9  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  31.07 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  31.53 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  31.37 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  31.58 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  28.97 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  48.89 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.27 
 
 		 533 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  27.74 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  27.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  27.07 
 
 		 565 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  31.93 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.28 
 
 		 438 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  32.29 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  27.07 
 
 		 565 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  27.07 
 
 		 565 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  29.73 
 
 		 241 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 		 241 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 		 241 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  54.05 
 
 		 214 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 		 221 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  29.63 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>