28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2473 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  53.41 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  50.27 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  49.7 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  37.82 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  36.48 
 
 		 693 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  32.67 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  31.97 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  36.24 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  31.65 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  30.58 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  30.58 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  27.11 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  35 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  28.12 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  24.04 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  27.42 
 
 		 244 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  30.97 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  28.03 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3057  protein tyrosine/serine phosphatase  31.13 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  27.19 
 
 		 565 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  28.77 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  27.19 
 
 		 565 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  27.19 
 
 		 565 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  42.86 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  23.6 
 
 		 165 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  25.89 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>