45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2817 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  99.36 
 
 
156 aa  323  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  89.74 
 
 
156 aa  298  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  87.18 
 
 
156 aa  291  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  87.82 
 
 
156 aa  291  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 
156 aa  290  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 
156 aa  289  8e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 
156 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 
156 aa  255  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  74.36 
 
 
156 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  72.44 
 
 
156 aa  239  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  64.1 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  58.71 
 
 
159 aa  208  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  50.64 
 
 
158 aa  163  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  34.29 
 
 
244 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  30.83 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  27.12 
 
 
533 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  32.73 
 
 
246 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  30.77 
 
 
478 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  31.25 
 
 
550 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  28.95 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  29.85 
 
 
547 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  27.97 
 
 
540 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  24.5 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  26.14 
 
 
507 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  28.97 
 
 
419 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 
241 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  40.32 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  30.48 
 
 
239 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  25 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  29.17 
 
 
560 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  35.62 
 
 
179 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  30.7 
 
 
563 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  30.7 
 
 
568 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  30.7 
 
 
563 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  30.7 
 
 
563 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  23.53 
 
 
197 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  30.09 
 
 
241 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  30.08 
 
 
565 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  30.08 
 
 
565 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  30.08 
 
 
565 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>