45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3916 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.45 
 
 		 539 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  36.26 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  30.99 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  32.89 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  31.69 
 
 		 500 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  27.03 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  30.19 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  26.95 
 
 		 438 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  44.12 
 
 		 463 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  29.45 
 
 		 478 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  28.87 
 
 		 370 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  40.91 
 
 		 419 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  33.64 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  29.66 
 
 		 167 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  29.73 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  29.85 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  30.77 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  26.8 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  24.65 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  46.81 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  31.03 
 
 		 363 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  30.65 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  27.21 
 
 		 156 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  26.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  30.3 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  26.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  34.18 
 
 		 540 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  26.14 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  28.35 
 
 		 565 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  23.68 
 
 		 545 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  27.5 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  42.31 
 
 		 346 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  25.32 
 
 		 156 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2630  hypothetical protein  28.68 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.371489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  27.56 
 
 		 565 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  29.58 
 
 		 243 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  42.22 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  23.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  23.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  23.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  27.56 
 
 		 565 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  29.49 
 
 		 547 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>