59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2528 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
156 aa  324  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  65.81 
 
 
159 aa  227  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  64.74 
 
 
156 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  63.46 
 
 
156 aa  221  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  63.46 
 
 
156 aa  219  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  63.46 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  64.1 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  66.03 
 
 
156 aa  218  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  65.38 
 
 
156 aa  217  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  64.1 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  64.1 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  64.1 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  63.46 
 
 
156 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  60.26 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  62.18 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  52.56 
 
 
158 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32.56 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  34.82 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  27.03 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  31.06 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  33.04 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  27.48 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  31.37 
 
 
232 aa  47.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.32 
 
 
539 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  29.52 
 
 
244 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  26.36 
 
 
507 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.15 
 
 
152 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  32.32 
 
 
246 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.35 
 
 
438 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  26.47 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  32.77 
 
 
243 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  28.44 
 
 
241 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  25.31 
 
 
165 aa  44.3  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  29.69 
 
 
167 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  29.2 
 
 
191 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  26.47 
 
 
189 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  22.58 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  29.36 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  31.03 
 
 
220 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  28.71 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  24.37 
 
 
269 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  26.52 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  29.23 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  26.47 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  28.87 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  34.19 
 
 
243 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  30.25 
 
 
478 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  31.48 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  38.82 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.46 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.26 
 
 
419 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  41.38 
 
 
289 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  26.47 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  26.06 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  28.81 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 
241 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>