63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1423 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  98.08 
 
 
156 aa  321  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  96.79 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  93.59 
 
 
156 aa  313  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  91.67 
 
 
156 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  87.82 
 
 
156 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  87.82 
 
 
156 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  87.82 
 
 
156 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 
156 aa  290  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 
156 aa  256  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 
156 aa  256  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 
156 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  74.36 
 
 
156 aa  249  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  63.46 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  60 
 
 
159 aa  208  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  54.19 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  39.32 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  40 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  38.46 
 
 
244 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.32 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  30.48 
 
 
232 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  32.23 
 
 
241 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  27.14 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  28.95 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  27.63 
 
 
507 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  30 
 
 
560 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  32.74 
 
 
241 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  31.58 
 
 
563 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 
563 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  31.58 
 
 
563 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  31.58 
 
 
568 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  34.52 
 
 
269 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  26.14 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  25.83 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  30.53 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  26.98 
 
 
241 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.27 
 
 
533 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  29.13 
 
 
202 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  30.84 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  34.74 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  31.53 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  32.77 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  47.62 
 
 
250 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  29.49 
 
 
243 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  25.42 
 
 
540 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  27.94 
 
 
565 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.28 
 
 
438 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  25.81 
 
 
221 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  30.63 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  28.04 
 
 
244 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  30.63 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  28.37 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  27.82 
 
 
565 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  27.94 
 
 
565 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  30.63 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  27.43 
 
 
246 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  30.68 
 
 
438 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  34.25 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  30.68 
 
 
430 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  30.68 
 
 
438 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  29.63 
 
 
430 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  31.48 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>