31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2078 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  98.34 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  79.25 
 
 		 241 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  77.59 
 
 		 241 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  77.18 
 
 		 241 aa  387  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  48.77 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  45.97 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  46.61 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  38.67 
 
 		 241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  37.56 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  44.5 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  44.66 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  42.23 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  42.23 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  35.68 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  33.72 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  32.06 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  27.22 
 
 		 693 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  27.61 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  25 
 
 		 363 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  23.81 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  29.71 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  26.96 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  27.92 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  27.07 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  29.73 
 
 		 162 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  25.47 
 
 		 168 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  28.21 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>