More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2673 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  59.27 
 
 		 547 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  75.96 
 
 		 568 aa  881    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1164    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  98.05 
 
 		 565 aa  1139    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  57.27 
 
 		 550 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  77.38 
 
 		 563 aa  880    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  98.41 
 
 		 565 aa  1149    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  76.73 
 
 		 563 aa  883    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  77.26 
 
 		 563 aa  886    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  72.14 
 
 		 560 aa  845    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  45.67 
 
 		 545 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  48.08 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  47.28 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  45.29 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  43.64 
 
 		 581 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  38.24 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  36.13 
 
 		 323 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  37.74 
 
 		 328 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  35.16 
 
 		 349 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  34.52 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  27.83 
 
 		 301 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  25.39 
 
 		 325 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  25.48 
 
 		 297 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  28.89 
 
 		 314 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  23.48 
 
 		 364 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  25.71 
 
 		 366 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0766  diacylglycerol kinase catalytic region  25.76 
 
 		 305 aa  90.9  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0749  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.76 
 
 		 305 aa  90.9  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.868968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  27.22 
 
 		 301 aa  90.5  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  27.17 
 
 		 302 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  28.19 
 
 		 379 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  23.44 
 
 		 364 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  30.21 
 
 		 287 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  26.79 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  29.32 
 
 		 300 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  27.02 
 
 		 392 aa  87.8  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  28.47 
 
 		 306 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  25.47 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  34.39 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.9 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  31.31 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  32.32 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  32.32 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1626  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.1 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01680  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  24.77 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.633077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  25.94 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  31.75 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.09 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  26.46 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  26.46 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  25.16 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.21 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  25.43 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  29.43 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  26.46 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.08 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  24.61 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  26.67 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  24.83 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.43 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  26.58 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  21.98 
 
 		 304 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.45 
 
 		 290 aa  76.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  26.78 
 
 		 308 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  31.31 
 
 		 296 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  27.8 
 
 		 361 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  26.52 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0721  diacylglycerol kinase catalytic region  28.68 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42692e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  29.2 
 
 		 288 aa  76.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0709  diacylglycerol kinase catalytic region  30 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  24.1 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  30.41 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  23.7 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01650  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  25 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  28.11 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  25 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  25.48 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  26.58 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  28.29 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  25.88 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  25.78 
 
 		 292 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  28.95 
 
 		 291 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.95 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  25.84 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  29.1 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  26.6 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0633  diacylglycerol kinase catalytic region  23.2 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000157302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.63 
 
 		 300 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  32.02 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  32.24 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>