55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1254 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  88.06 
 
 		 471 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 467 aa  904    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  88.91 
 
 		 471 aa  756    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  95.02 
 
 		 467 aa  770    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  89.1 
 
 		 468 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  88.06 
 
 		 471 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  54.82 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  47.86 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  49.88 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  43.82 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  47.37 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  47.62 
 
 		 449 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  43.91 
 
 		 449 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  39.63 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  42.43 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  37.75 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  35.96 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  37.05 
 
 		 430 aa  237  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  37.27 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  37.27 
 
 		 430 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  38.84 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  38.84 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  38.84 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  37.27 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  35.73 
 
 		 430 aa  232  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  35.51 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  35.51 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  37.19 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  36.51 
 
 		 428 aa  227  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.18 
 
 		 478 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  54.7 
 
 		 132 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  31.96 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  30.3 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  30.41 
 
 		 563 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  29.91 
 
 		 563 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  30.41 
 
 		 568 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  29.91 
 
 		 563 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  31.63 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  31.63 
 
 		 565 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  34.76 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  29.95 
 
 		 560 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  30.52 
 
 		 565 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  29.81 
 
 		 533 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  30.3 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  29.28 
 
 		 581 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  29.03 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  34.76 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.55 
 
 		 238 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.5 
 
 		 202 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35464  predicted protein  28.03 
 
 		 196 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  23.98 
 
 		 169 aa  47.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  30.07 
 
 		 206 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  28.57 
 
 		 180 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.77 
 
 		 217 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.95 
 
 		 217 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>