30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1848 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3303  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.4 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.306243  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4168  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.85 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0537  PAP2 family protein  49.75 
 
 		 293 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0694  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.24 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000042298  unclonable  0.000000000111992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2238  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  47.37 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1372  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.47 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.89 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2021  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.48 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  32.22 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  29.1 
 
 		 471 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  29.1 
 
 		 471 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.48 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  28.57 
 
 		 471 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.99 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  29.95 
 
 		 468 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  28.98 
 
 		 439 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  28.98 
 
 		 439 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  28.98 
 
 		 439 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  27.55 
 
 		 467 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  26.7 
 
 		 467 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3885  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0673  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.02 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.918939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  27.52 
 
 		 449 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.33 
 
 		 478 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  29.05 
 
 		 451 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00861  hypothetical protein  33.15 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  27.15 
 
 		 447 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>