40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00861 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00861  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.03 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.39 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  34.86 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3885  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.77 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2121  Ser/Thr and Tyr protein phosphatase (dual specificity)#  26.38 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000187459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  29.52 
 
 		 438 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  29.52 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  29.52 
 
 		 430 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  29.52 
 
 		 430 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  29.52 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0673  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.46 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.918939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.39 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  28.92 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  28.92 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  28.92 
 
 		 430 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2878  hypothetical protein  29.45 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  28.92 
 
 		 438 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.85 
 
 		 478 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.85 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  33.15 
 
 		 447 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.15 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  30.92 
 
 		 444 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0102  PAP2 family protein  29.63 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000373231  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4866  PAP2 family protein  29.01 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  29.63 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  29.01 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5238  PAP2 family protein  29.01 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  28.18 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5138  PAP2 family protein  29.01 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000319321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4824  PAP2 family protein  28.4 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00045347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  30 
 
 		 439 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  30 
 
 		 439 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  30 
 
 		 439 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  28.4 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  28.4 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  28.4 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3303  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.81 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.306243  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1932  phosphatase  23.12 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0283031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  31.37 
 
 		 449 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>