More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2848 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  71.81 
 
 
560 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  59.09 
 
 
547 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  76.88 
 
 
563 aa  883    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  98.41 
 
 
565 aa  1149    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  97.52 
 
 
565 aa  1139    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  57.27 
 
 
550 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  77.06 
 
 
563 aa  880    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1164    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  76.7 
 
 
568 aa  879    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  77.42 
 
 
563 aa  886    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  46.4 
 
 
545 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  48.08 
 
 
533 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  47.28 
 
 
540 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  44.95 
 
 
552 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  42.97 
 
 
581 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  38.89 
 
 
435 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  35.81 
 
 
323 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  37.08 
 
 
328 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  35.81 
 
 
349 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  34.19 
 
 
322 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  28.44 
 
 
301 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  25.8 
 
 
297 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  25.7 
 
 
325 aa  97.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  27.83 
 
 
301 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  23.48 
 
 
364 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  29.52 
 
 
314 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  28.52 
 
 
379 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  26.15 
 
 
366 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  30.9 
 
 
287 aa  90.9  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  23.44 
 
 
364 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  27.33 
 
 
392 aa  89  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0749  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.15 
 
 
305 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.868968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0766  diacylglycerol kinase catalytic region  25.15 
 
 
305 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  26.81 
 
 
302 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  29.01 
 
 
300 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  28.47 
 
 
306 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  25.68 
 
 
309 aa  87  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  25.47 
 
 
326 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.9 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  34.39 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  25.77 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1626  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.1 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151612  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  31.75 
 
 
302 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
471 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01680  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  24.62 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.18 
 
 
328 aa  82  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
471 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  32.26 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.21 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  30.56 
 
 
303 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  25.94 
 
 
312 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  24.38 
 
 
303 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  26.46 
 
 
315 aa  80.1  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  26.46 
 
 
315 aa  80.1  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  27.12 
 
 
308 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.43 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.08 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  26.46 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  21.98 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  24.84 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.13 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  29.2 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0709  diacylglycerol kinase catalytic region  30 
 
 
289 aa  77  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  24.46 
 
 
300 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  26.67 
 
 
299 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0721  diacylglycerol kinase catalytic region  28.68 
 
 
289 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42692e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  26.2 
 
 
296 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  26.58 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  26.52 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  24.49 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  27.39 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  27.61 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  25.36 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  30.09 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  25.47 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  33.54 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  28.29 
 
 
293 aa  73.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12281  diacylglycerol kinase  27.03 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.538329  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  26.58 
 
 
300 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  25.48 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  28.95 
 
 
291 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.95 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  26.01 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0633  diacylglycerol kinase catalytic region  23.2 
 
 
301 aa  72  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000157302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  24.77 
 
 
304 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  24.52 
 
 
288 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  29.25 
 
 
302 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  32.02 
 
 
467 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01650  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  25 
 
 
381 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  27.92 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>