More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0709 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0709  diacylglycerol kinase catalytic region  100 
 
 
289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0721  diacylglycerol kinase catalytic region  93.43 
 
 
289 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42692e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1626  diacylglycerol kinase, catalytic region  60.34 
 
 
290 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2741  hypothetical protein  56.55 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.320783  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0876  diacylglycerol kinase catalytic subunit  53.08 
 
 
289 aa  279  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.742503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3148  diacylglycerol kinase, catalytic region  48.78 
 
 
288 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2483  diacylglycerol kinase catalytic region  48.78 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  36.21 
 
 
323 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  38.93 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  34.69 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  33.22 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0800  hypothetical protein  36.11 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1879  diacylglycerol kinase catalytic region  37.5 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0154077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  32.65 
 
 
325 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  34.26 
 
 
364 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  29.86 
 
 
308 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  29.19 
 
 
301 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  29.53 
 
 
301 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  29.19 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  29.19 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  29.19 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  29.19 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  28.86 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  28.86 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  29.19 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  28.86 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  29.19 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  29.39 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.12 
 
 
367 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  27.49 
 
 
293 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  28.01 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  28.01 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  26.9 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  30.38 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  29.51 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  28.72 
 
 
300 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  26.09 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  31.25 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  26.3 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  29.63 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.86 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.29 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  31.46 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  28.28 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  30.29 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  28.28 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  25.61 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  25.61 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0378  diacylglycerol kinase catalytic region  29.63 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal  0.4677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.88 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  28.63 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  27.67 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  31.49 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  25.91 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3694  diacylglycerol kinase catalytic region  30.16 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2148  diacylglycerol kinase catalytic region  29.8 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  26.25 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  28.43 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  26.09 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2741  diacylglycerol kinase catalytic region  27.46 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  25.26 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  31.01 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1339  diacylglycerol kinase catalytic region  31.27 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.219636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  25.26 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  25.26 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  25.26 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  30.07 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4650  hypothetical protein  28.66 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.303181  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0393  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.25 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0393706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  27.81 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  28.77 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  28.17 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  26.28 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7710  diacylglycerol kinase catalytic region  29.81 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0869  diacylglycerol kinase catalytic region  26.38 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  25.25 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  30 
 
 
565 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1578  putative lipid kinase  27.42 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  27.81 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  29.29 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  28.88 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  27.6 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  30 
 
 
565 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  24.32 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  30 
 
 
565 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  27.3 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  30.39 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  26.86 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01680  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  31.03 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8305  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  27.33 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.21 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1118  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.34 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.867073  decreased coverage  0.00200137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  24.64 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  29.55 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  25.42 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1424  diacylglycerol kinase catalytic region  32.07 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4192  diacylglycerol kinase catalytic region  28.18 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.128995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1757  diacylglycerol kinase catalytic region  26.39 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>