More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3998 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  59.03 
 
 		 563 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  58.84 
 
 		 568 aa  686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  60.88 
 
 		 547 aa  687    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  58.48 
 
 		 563 aa  682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  57.27 
 
 		 565 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  57.27 
 
 		 565 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1131    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  57.27 
 
 		 565 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  58.84 
 
 		 563 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  60 
 
 		 560 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  50.46 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  49.61 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  49.43 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  45.12 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  42.28 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  37.34 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  36.22 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  34.43 
 
 		 328 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  32.38 
 
 		 323 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  36.42 
 
 		 322 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  28.12 
 
 		 364 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.73 
 
 		 367 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  27.71 
 
 		 302 aa  103  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  34.39 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  26.84 
 
 		 297 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  29.08 
 
 		 314 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  30.63 
 
 		 293 aa  97.1  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  26.45 
 
 		 294 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  33.87 
 
 		 471 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  26.64 
 
 		 309 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  29.26 
 
 		 287 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  26.54 
 
 		 296 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  26.46 
 
 		 366 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  27.76 
 
 		 300 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  25.56 
 
 		 306 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  26.83 
 
 		 292 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  29.5 
 
 		 288 aa  94.4  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  33.87 
 
 		 471 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  33.87 
 
 		 471 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  27.85 
 
 		 301 aa  94  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  26.98 
 
 		 326 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  25.97 
 
 		 392 aa  92.8  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  38.64 
 
 		 274 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  25.66 
 
 		 312 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  91.3  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.45 
 
 		 506 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  25.71 
 
 		 301 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  25.71 
 
 		 301 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  32.81 
 
 		 467 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  27.18 
 
 		 302 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  26.78 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  27.18 
 
 		 302 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  26.76 
 
 		 300 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  26.76 
 
 		 300 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  26.76 
 
 		 300 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  26.76 
 
 		 300 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.76 
 
 		 290 aa  88.6  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  26.77 
 
 		 316 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  26.8 
 
 		 325 aa  88.2  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  25.63 
 
 		 300 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  26.76 
 
 		 300 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  28.62 
 
 		 287 aa  87.8  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  32.42 
 
 		 438 aa  87  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  32.42 
 
 		 430 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  26.42 
 
 		 300 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  31.96 
 
 		 438 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  26.42 
 
 		 300 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  26.42 
 
 		 300 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  26.42 
 
 		 300 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  25.6 
 
 		 315 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  25.95 
 
 		 406 aa  86.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  32.6 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  25.4 
 
 		 304 aa  86.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  25 
 
 		 328 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  25.6 
 
 		 315 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  25.82 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  31.02 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  26.6 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  31.48 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  26.61 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  27.33 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  31.51 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  31.51 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  30.94 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  29.41 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  31.51 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  25.33 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  24.06 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  25.32 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12281  diacylglycerol kinase  28.04 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.538329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  24.37 
 
 		 304 aa  83.2  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  28.26 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  27.2 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>