More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3710 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  60.75 
 
 		 563 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1118    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  59.27 
 
 		 565 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  59.49 
 
 		 565 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  60.88 
 
 		 550 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  59.09 
 
 		 565 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  60.75 
 
 		 563 aa  710    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  60.57 
 
 		 563 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  61.37 
 
 		 568 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  60.47 
 
 		 560 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  47.96 
 
 		 545 aa  528  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  47.47 
 
 		 533 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  48.44 
 
 		 540 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  43.96 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  43.15 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  35.39 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  36.39 
 
 		 435 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  35.35 
 
 		 328 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  35.74 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  34.42 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  29.6 
 
 		 304 aa  104  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  26.18 
 
 		 361 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  25.4 
 
 		 325 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  25.89 
 
 		 364 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  23.46 
 
 		 366 aa  86.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  25.57 
 
 		 303 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.33 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  26.22 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  26.33 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  26.3 
 
 		 326 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  26.14 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.39 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  30.81 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3028  diacylglycerol kinase catalytic region  24.45 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  25.79 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  25.72 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  23.3 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.5 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  28.08 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  28.08 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.73 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  25.64 
 
 		 392 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  28.08 
 
 		 301 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  27.31 
 
 		 287 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  24.35 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  24.43 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  30.1 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  28.08 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  29.8 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  24.08 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.47 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  24.45 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  29.8 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  27.72 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0390  bmrU protein  26.82 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  25.81 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  26.6 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  25.81 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  27.24 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.86 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  24.59 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  32.2 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  29.8 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  30.16 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  25.64 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  27.76 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  27.05 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  25.71 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.08 
 
 		 300 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  22.79 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  27.1 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.08 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  33.53 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  28.97 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  28.4 
 
 		 300 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5857  hypothetical protein  27.42 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  28.97 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  33.53 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  26.17 
 
 		 300 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  26.17 
 
 		 300 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01650  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  26.81 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  26.17 
 
 		 300 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  27.24 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  25.18 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  27.31 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  34.75 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  30.32 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0766  diacylglycerol kinase catalytic region  27.65 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0749  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.65 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.868968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0378  diacylglycerol kinase catalytic region  24.32 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal  0.4677 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  26.24 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  25.34 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  21.81 
 
 		 288 aa  70.1  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>