More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2741 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  71.99 
 
 
560 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  77.02 
 
 
563 aa  881    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  59.49 
 
 
547 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  76.84 
 
 
563 aa  883    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  98.05 
 
 
565 aa  1139    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1166    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  57.27 
 
 
550 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  97.52 
 
 
565 aa  1139    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  76.8 
 
 
568 aa  880    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  77.38 
 
 
563 aa  886    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  45.68 
 
 
545 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  47.89 
 
 
533 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  46.89 
 
 
540 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  44.57 
 
 
552 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  43.16 
 
 
581 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  38.31 
 
 
435 aa  186  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  35.81 
 
 
323 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  37.46 
 
 
328 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  34.84 
 
 
349 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  34.52 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  27.52 
 
 
301 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  25.39 
 
 
325 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  25.48 
 
 
297 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  29.87 
 
 
314 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0766  diacylglycerol kinase catalytic region  25.76 
 
 
305 aa  93.6  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0749  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.76 
 
 
305 aa  93.6  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.868968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  29.15 
 
 
306 aa  92  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  29 
 
 
379 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  24.22 
 
 
364 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  26.91 
 
 
301 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  23.48 
 
 
364 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  25.71 
 
 
326 aa  87.8  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  26.81 
 
 
302 aa  87.4  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  25.44 
 
 
366 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.9 
 
 
301 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  29.86 
 
 
287 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.87 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  25.79 
 
 
303 aa  84  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  24.32 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  29.71 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  31.75 
 
 
302 aa  82.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  28.8 
 
 
303 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1626  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.1 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.77 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  28.7 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  25.79 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  26.62 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.71 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.69 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  25.09 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  32.26 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  32.26 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  26.19 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  31.18 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  27.46 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  22.29 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  29.65 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0709  diacylglycerol kinase catalytic region  30 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  31.31 
 
 
296 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  26.67 
 
 
299 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  23.7 
 
 
288 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  35.66 
 
 
274 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  26.58 
 
 
300 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  31.12 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  26.77 
 
 
316 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0721  diacylglycerol kinase catalytic region  30.05 
 
 
289 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42692e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  24.29 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  26.15 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  26.15 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01680  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  24.02 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  26.17 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  28.21 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01650  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  25.37 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12281  diacylglycerol kinase  27.63 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.538329  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  26.58 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  27.39 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  29.38 
 
 
303 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.95 
 
 
300 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  27.91 
 
 
293 aa  72.8  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  33.95 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  25 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  23.75 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.63 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  25.56 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  26.67 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  26.67 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  26.67 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  29.1 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  23.1 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5857  hypothetical protein  26.77 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.924952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>