66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  95.42 
 
 
449 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  64.85 
 
 
451 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  63.53 
 
 
445 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  58.87 
 
 
444 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  51.95 
 
 
449 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  51.28 
 
 
464 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  44.31 
 
 
437 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  46.27 
 
 
447 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  47.6 
 
 
468 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  47 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  47.61 
 
 
471 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  47.37 
 
 
471 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  47.37 
 
 
471 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  47.13 
 
 
467 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  43.06 
 
 
439 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  43.06 
 
 
439 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  41.99 
 
 
428 aa  296  5e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  43.06 
 
 
439 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  45.11 
 
 
428 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  39.86 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  40.19 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  39.86 
 
 
430 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  39.86 
 
 
430 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  39.86 
 
 
430 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  39.86 
 
 
430 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  39.62 
 
 
430 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  40.1 
 
 
438 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  40.1 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  40.34 
 
 
478 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  63.56 
 
 
132 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  36.99 
 
 
246 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  33.19 
 
 
552 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  31.43 
 
 
581 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  34 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  31.14 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  27.15 
 
 
550 aa  67  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  28.04 
 
 
563 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  34.08 
 
 
565 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  30.26 
 
 
533 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  28.04 
 
 
568 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  28.04 
 
 
563 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  28.04 
 
 
563 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  34.08 
 
 
565 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.43 
 
 
202 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  33.52 
 
 
565 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  30.54 
 
 
547 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  28.05 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  29.76 
 
 
215 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  29.34 
 
 
215 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  30.36 
 
 
219 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  29.34 
 
 
215 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  28.74 
 
 
169 aa  50.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4866  PAP2 family protein  29.34 
 
 
215 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0102  PAP2 family protein  29.76 
 
 
215 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000373231  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5238  PAP2 family protein  29.34 
 
 
215 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5138  PAP2 family protein  29.17 
 
 
215 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000319321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  28.57 
 
 
215 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  28.57 
 
 
215 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4824  PAP2 family protein  29.17 
 
 
215 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00045347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  35.05 
 
 
180 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.54 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  34.94 
 
 
178 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  31.76 
 
 
463 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  40 
 
 
158 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.27 
 
 
217 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>