47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1746 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  83.97 
 
 		 156 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  76.92 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  258  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  75.64 
 
 		 156 aa  256  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  77.56 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 		 156 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  61.29 
 
 		 159 aa  207  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  50.64 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  35.71 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  36.75 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  27.91 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  34.23 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  25.86 
 
 		 533 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  31.62 
 
 		 346 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  27.93 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  28.81 
 
 		 478 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  26.36 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  25.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  27.27 
 
 		 438 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  32.43 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  30.36 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  35.19 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  46.67 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  35.82 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  30.97 
 
 		 568 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  23.78 
 
 		 162 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  30.97 
 
 		 563 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  30.97 
 
 		 563 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  30.97 
 
 		 563 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  47.37 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  30.36 
 
 		 189 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  24.64 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  28.81 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  36.78 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  26.5 
 
 		 370 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  27.87 
 
 		 369 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  25.71 
 
 		 241 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  28.72 
 
 		 550 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  22.7 
 
 		 419 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>