87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3944 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  79.78 
 
 		 181 aa  290  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  58.49 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  37.6 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  40.91 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  29.17 
 
 		 581 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  40 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  31.58 
 
 		 565 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  32.33 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  31.58 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  40 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  30.66 
 
 		 560 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  38.18 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  29.93 
 
 		 563 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  29.93 
 
 		 563 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  29.93 
 
 		 563 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  29.93 
 
 		 568 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  37.3 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  36.84 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  30.22 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  30.15 
 
 		 545 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  26.81 
 
 		 540 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  34.82 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  33.58 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  33.91 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  29.85 
 
 		 547 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  34.23 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  25.74 
 
 		 533 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.01 
 
 		 478 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  36.36 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  29.03 
 
 		 269 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  30.23 
 
 		 438 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  24.09 
 
 		 552 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  34.82 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  32.56 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  32.76 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  27.97 
 
 		 550 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  29.93 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  30.95 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  42.03 
 
 		 507 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  33.64 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  32.43 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3932  Dual specificity protein phosphatase  33.93 
 
 		 202 aa  47.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4369  dual specificity protein phosphatase  26.11 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00129  protein tyrosine phosphatase Pps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11690)  26.71 
 
 		 689 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  36.36 
 
 		 363 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  36.05 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  34.52 
 
 		 449 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  35.14 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  25.36 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  32.56 
 
 		 430 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  32.56 
 
 		 438 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  32.56 
 
 		 438 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  34.94 
 
 		 437 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35464  predicted protein  31.87 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3127  dual specificity protein phosphatase  30.59 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368556  normal  0.033409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 468 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  34.83 
 
 		 471 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  24.79 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  34.83 
 
 		 471 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  43.4 
 
 		 179 aa  44.3  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  30.14 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  32.56 
 
 		 430 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  32.56 
 
 		 430 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  32.56 
 
 		 430 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  32.56 
 
 		 430 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  32.56 
 
 		 430 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  27.46 
 
 		 430 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  33.71 
 
 		 471 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  28.69 
 
 		 370 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  30.34 
 
 		 464 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.97 
 
 		 419 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  28.47 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  44 
 
 		 463 aa  41.2  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  32.71 
 
 		 346 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  29.06 
 
 		 428 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>