43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43165 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  100 
 
 
269 aa  558  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.15 
 
 
533 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  31.13 
 
 
540 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  22.87 
 
 
565 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  22.87 
 
 
565 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  27.48 
 
 
545 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  22.87 
 
 
565 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.84 
 
 
419 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  24.34 
 
 
552 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  22.17 
 
 
550 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  30.1 
 
 
369 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  23.26 
 
 
560 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  25.97 
 
 
581 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.04 
 
 
478 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  22.79 
 
 
563 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  22.79 
 
 
568 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  29.03 
 
 
178 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  22.62 
 
 
563 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  22.79 
 
 
563 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  29.84 
 
 
500 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  30.63 
 
 
147 aa  48.9  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  20.98 
 
 
547 aa  48.9  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  37.88 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  37.21 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  27.39 
 
 
181 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  31.3 
 
 
191 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  29.27 
 
 
507 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  24.54 
 
 
370 aa  45.4  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  32.67 
 
 
449 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04544  protein-tyrosine phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02760)  35.48 
 
 
702 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0134792  normal  0.176714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  30.43 
 
 
189 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  29.73 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35464  predicted protein  28.33 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  29.09 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00129  protein tyrosine phosphatase Pps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11690)  24.44 
 
 
689 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02800  protein tyrosine/threonine phosphatase, putative  28.95 
 
 
1114 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  24.22 
 
 
162 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  27.85 
 
 
169 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0063  dual specificity protein phosphatase  30.77 
 
 
146 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  29.03 
 
 
167 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  24.37 
 
 
156 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>