67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1106 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  79.78 
 
 		 178 aa  290  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  56.33 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  35.94 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  40.17 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  40.17 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  39.32 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  29.17 
 
 		 581 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  37.61 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  36.75 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  30.71 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  30.08 
 
 		 565 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  35.54 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  29.79 
 
 		 560 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  31.58 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  30.66 
 
 		 565 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  34.21 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  33.58 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  29.08 
 
 		 563 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  29.08 
 
 		 563 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  29.08 
 
 		 568 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  29.08 
 
 		 563 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  29.63 
 
 		 246 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.24 
 
 		 533 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  32.48 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.78 
 
 		 478 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  33.04 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  28.17 
 
 		 540 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00129  protein tyrosine phosphatase Pps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11690)  26.38 
 
 		 689 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  35.37 
 
 		 547 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  33.63 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  31.4 
 
 		 438 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  36.99 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  34.41 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  27.39 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  37.5 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  26.06 
 
 		 550 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  23.53 
 
 		 552 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4369  dual specificity protein phosphatase  27.81 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  36.49 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  29.71 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  37.08 
 
 		 468 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  31.4 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  30.43 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  37.21 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  29.13 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  31.03 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  26.19 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  30.08 
 
 		 471 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  30.08 
 
 		 471 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.97 
 
 		 419 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  25.95 
 
 		 370 aa  42  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  36.62 
 
 		 155 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35464  predicted protein  30.77 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  43.4 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 449 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  34.48 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>