57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1546 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 162 aa  333  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  37.23 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  30.83 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  25.86 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  26.06 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.27 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  28.47 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  28.78 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  24.43 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  27.82 
 
 		 438 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  28.7 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  23.93 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  28.89 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25.32 
 
 		 490 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  26.98 
 
 		 507 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  28.12 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  23.78 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  37.33 
 
 		 560 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  23.84 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  27.35 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  36 
 
 		 563 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.55 
 
 		 533 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  36 
 
 		 568 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  36 
 
 		 563 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  26.95 
 
 		 550 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  36 
 
 		 563 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.81 
 
 		 505 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  25.64 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  26.95 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  25 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  23.93 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2630  hypothetical protein  32.1 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.371489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  29.73 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  26.23 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.93 
 
 		 539 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  32 
 
 		 547 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  29.2 
 
 		 565 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  29.2 
 
 		 565 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  26.24 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  29.2 
 
 		 565 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  22.83 
 
 		 182 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  26.49 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  23.53 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  28.99 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  25.34 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  34.48 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  27.08 
 
 		 269 aa  40.8  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  33.96 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  26.45 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  29.66 
 
 		 370 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>