40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1139 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 140 aa  289  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  37.23 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  30.66 
 
 		 438 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.47 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.77 
 
 		 508 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  29.82 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  26.77 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  30.65 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.88 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  33.05 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  29.66 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  28.23 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  27.43 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  31.46 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  28.78 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  28.79 
 
 		 179 aa  57  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.41 
 
 		 539 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.35 
 
 		 505 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.32 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  25.45 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  27.84 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  27.01 
 
 		 209 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  27.97 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  22.58 
 
 		 162 aa  48.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.03 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  28.99 
 
 		 507 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 		 369 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  28.89 
 
 		 478 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  36.76 
 
 		 171 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  29.2 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  22.73 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  24.75 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  24.75 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  26.67 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  27.03 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  28.89 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  27.91 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>