44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1966 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  45.74 
 
 		 508 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  44.75 
 
 		 505 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  43.82 
 
 		 188 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  44 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  43.43 
 
 		 182 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  42.46 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  41.57 
 
 		 490 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  40.37 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  34.29 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  33.72 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  34.87 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  34.68 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  32.37 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  29.49 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  28.25 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.94 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 438 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  35.76 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  32.38 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.2 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  36.67 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  28.08 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  28.24 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  27.65 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  29.66 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  30.06 
 
 		 507 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  26.49 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  28.26 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  26.15 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  32.56 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  27.38 
 
 		 369 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  33.68 
 
 		 161 aa  48.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  31.25 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  31.4 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  27.35 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  34.78 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  29.41 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  46.67 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3127  dual specificity protein phosphatase  35.59 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368556  normal  0.033409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 		 168 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  32.88 
 
 		 171 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  26.72 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>