44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1521 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 166 aa  333  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  51.23 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  39.38 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  35.44 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  40.74 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  40.74 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  35.19 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  36.65 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  36.65 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.54 
 
 		 505 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  34.94 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  34.48 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  31.76 
 
 		 209 aa  88.2  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.74 
 
 		 508 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.95 
 
 		 490 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  28.25 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  33.97 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  30.63 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32.39 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  32.32 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  34.75 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  28.23 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  42.5 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  31.15 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.35 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  25.49 
 
 		 438 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  23.93 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  27.41 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  29.63 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  30.82 
 
 		 507 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  35.37 
 
 		 540 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  34.19 
 
 		 478 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  30.09 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  26.09 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  28.12 
 
 		 500 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  34.48 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05057  protein-tyrosine phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12250)  41.07 
 
 		 595 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000599023  hitchhiker  0.0000000000000767856 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  37.1 
 
 		 562 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3127  dual specificity protein phosphatase  33.9 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368556  normal  0.033409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  23.4 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>