24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6060 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  63.97 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  63.31 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  58.27 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  52.94 
 
 		 183 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  54.55 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  51.47 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  52.21 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  47.79 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  58.95 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  47.73 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  46.56 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  46.85 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  46.48 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2319  hypothetical protein  57.89 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0507937  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  40.58 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  35.48 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  37.08 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  34.48 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  34.15 
 
 		 179 aa  42.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.68 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 197 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  34.62 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  37.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>