23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3138 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  78.01 
 
 
142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  64.03 
 
 
183 aa  180  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  65.25 
 
 
142 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  76.26 
 
 
158 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  66.67 
 
 
144 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  62.96 
 
 
144 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  54.29 
 
 
170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  60.15 
 
 
143 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  54.41 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  51.97 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  50.72 
 
 
169 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  50 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  51.8 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2319  hypothetical protein  52.63 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0507937  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  41.18 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  37.08 
 
 
197 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  36.67 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  43.64 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  38.55 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
438 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  30.36 
 
 
206 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>