63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1579 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
155 aa  308  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  40.13 
 
 
179 aa  114  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  37.16 
 
 
197 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  40 
 
 
189 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  38.31 
 
 
508 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  37.66 
 
 
209 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  36.94 
 
 
182 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
438 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  37.66 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  38.33 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  35.26 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  35.76 
 
 
197 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.06 
 
 
505 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.65 
 
 
490 aa  73.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  36.97 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  36.84 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  37.08 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  34.75 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  30.83 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  28.78 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  31.15 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  28.47 
 
 
168 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  30.88 
 
 
206 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  32.63 
 
 
507 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.94 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  32.79 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  25.69 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  30.68 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  31.82 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  37.04 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  27.62 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  37.68 
 
 
562 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  31.16 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  33.93 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  30.33 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  36.36 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  40 
 
 
144 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  35.19 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  25.21 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  31.48 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  28.85 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  28.41 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04770  phosphoprotein phosphatase, putative  31.65 
 
 
761 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00163033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  32.14 
 
 
478 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  30.14 
 
 
169 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  36.62 
 
 
181 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  29.57 
 
 
188 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  34.62 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  37.5 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1539  Dual specificity protein phosphatase  26.19 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0521424  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  30 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  34.62 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  31.48 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  31.48 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  27.91 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  29.63 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  35.42 
 
 
189 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  31.48 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>