35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1243 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
143 aa  269  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  68.25 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  55.15 
 
 
142 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  67.68 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  54.26 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  60 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  49.25 
 
 
170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  47.73 
 
 
183 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  49.3 
 
 
144 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  50.76 
 
 
144 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  47.73 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  53.62 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  51.69 
 
 
138 aa  87.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  43.57 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  44.93 
 
 
189 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  35.11 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  32.05 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3127  dual specificity protein phosphatase  31.65 
 
 
166 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368556  normal  0.033409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  37.33 
 
 
197 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
438 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  35.37 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04680  protein-tyrosine-phosphatase, putative  35.44 
 
 
1409 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.727329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  31.67 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  55 
 
 
507 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  39.76 
 
 
508 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  44.44 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  30.95 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  38.27 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  28.41 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  44.93 
 
 
209 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  38.75 
 
 
147 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06982  protein tyrosine phosphatase (Pyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04710)  35.63 
 
 
685 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  41.54 
 
 
505 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2630  hypothetical protein  32.18 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.371489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  37.88 
 
 
182 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>