25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5017 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  334  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  67.55 
 
 
170 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  63.77 
 
 
142 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  57.46 
 
 
138 aa  150  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  51.82 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  49.64 
 
 
183 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  46.48 
 
 
142 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  44.68 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2319  hypothetical protein  71.64 
 
 
149 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0507937  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  43.57 
 
 
143 aa  94.4  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  43.7 
 
 
144 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  54.55 
 
 
133 aa  85.1  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  50 
 
 
143 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  44.14 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  45.16 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  37.5 
 
 
121 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  39.13 
 
 
185 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  40 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  30.77 
 
 
438 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  34.48 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.5 
 
 
508 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2630  hypothetical protein  25.45 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.371489 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  29.41 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  35.37 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>