17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  273  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  62.5 
 
 		 170 aa  163  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  58.27 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  57.46 
 
 		 169 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  48.03 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  48.82 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  48.44 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  43.31 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  47.9 
 
 		 158 aa  95.9  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  46.03 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  51.69 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  48.51 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  52.17 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2319  hypothetical protein  63.27 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0507937  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  47.19 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  37.18 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 179 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>