19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2695 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  68.12 
 
 
142 aa  200  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  66.67 
 
 
142 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  66.91 
 
 
144 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  68.84 
 
 
158 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  59.71 
 
 
144 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  64.03 
 
 
143 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  52.94 
 
 
142 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  51.82 
 
 
170 aa  127  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  48.94 
 
 
169 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  48.03 
 
 
138 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  47.73 
 
 
143 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  50 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  43.26 
 
 
141 aa  95.5  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2319  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0507937  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  36.96 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04680  protein-tyrosine-phosphatase, putative  32.58 
 
 
1409 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.727329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  38.98 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  38.04 
 
 
121 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>